Zestawy odczynników Agilent SureSelect
W związku ze zmianą domeny na Altium, informacje dotyczące produktów z tej kategorii dostępne są pod nowym adresem:
Zestawy odczynników Agilent SureSelect
Poniższa tabela zawiera podsumowanie głównych cech poszczególnych zestawów:
Nazwa zestawu | |||||
Ilość DNA | 10ng-200ng | 10ng-200ng | 200ng-3ug | 100ng-1ug | 50ng |
Czas pracy | 8 godzin | 8 godzin | 1,5 dnia | 1,5 dnia | 8 godzin |
Fragmentacja DNA | Sonikacja | Sonikacja | Sonikacja | Sonikacja | Trawienie transpozazą |
Czas hybrydyzacji | 90 minut | 90 minut | 16 godzin | 16 godzin | 90 minut |
Unikatowe cechy | Zoptymalizowane do FFPE Molekularne barkody Próbki indeksowane przed hybrydyzacją | Zoptymalizowane do FFPE Molekularne barkody Próbki indeksowane przed hybrydyzacją | Kompatybilne z FFPE | Pulowanie próbek przed hybrydyzacją | Kompatybilne z WGS i ukierunkowanym NGS
|
Kluczowe korzyści | Wysoka czułość: ≤1% VAF | Indeksy dla 192 próbek | Bardzo złożone próbki | Ekonomiczne | Nie wymaga sonikacji |
Każdy zestaw Agilent SureSelect może zostać zautomatyzowany na stacji pipetującej Bravo. Dzięki temu uzyskamy w pełni powtarzalne wyniki w znacznie krótszym czasie.
Agilent oferuje również rozwiązania do kontroli jakości poszczególnych etapów przygotowania bibliotek do NGS. Należą do nich:
- Ocena jakości genomowego DNA po izolacji:
- za pomocą Tapestation,
- za pomocą Real Time PCR – zestaw FFPE QC.
W przypadku próbek FFPE bardzo ważna jest ocena stopnia degradacji DNA. Ma to kluczowe znaczenie dla ilości cykli w PCR oraz dla ilości sekwencjonowania dla danej próbki.
- Ocena DNA: po fragmentacji, przed hybrydyzacją, przed multipleksowaniem
- za pomocą Tapestation,
- za pomocą Bioanalyzer 2100.