RNAseq

RNA-seq – ukierunkowane sekwencjonowanie transkryptomu

SureSelect RNA Direct umożliwia utworzenie gotowej do sekwencjonowania biblioteki dla wybranych transkryptów. Podczas przygotowywania biblioteki nie ma osobnych etapów deplecji rRNA czy selekcji tylko transkryptów z polyA. Wychwycenie docelowych fragmentów RNA odbywa się dzięki hybrydyzacji do sond oligonukleotydowych SureSelect.

Za pomocą programu SureDesign lub przy współpracy z Perlan Technologies każdy może zaprojektować swój własny panel sond SureSelect, które umożliwią ukierunkowanie RNA-seq.

Rozwiązanie RNA Direct:

  • jest kompatybilne również z materiałem o niskiej jakości np. izolowanym z FFPE,
  • umożliwia identyfikację fuzji genowych
  • umożliwia profilowanie ekspresji genów

W ofercie Agilent dostępne są dwa katalogowe panele do RNA-seq: All exon V6+UTR oraz Comprehensive Cancer panel obejmujący 150 genów.

Single Cell Gene Expression  

Rozwiązanie Chromium Single Cell Gene Expression firmy 10x Genomics umożliwia pełną charakterystykę i profilowanie ekspresji genów w tysiącach komórek jednocześnie. Biblioteka do sekwencjonowania jest gotowa w ciągu jednego dnia. Profilowanie ekspresji z rozdzielczością pojedynczej komórki jest kluczowe m.in. dla zrozumienia mechanizmów rozwoju, w którym każda komórka ma unikatową rolę.

Oferujemy pełne rozwiązanie: od przygotowania komórek do analizy do analizy wyników. Sekwencjonowanie odbywa się na sekwenatorach firmy Illumina. 

Pobierz broszurę Single Cell Gene Expression

Cechy systemu Chromium:

  • pełne rozwiązanie od zawiesiny komórek do gotowej do sekwencjonowania biblioteki,
  • wysoka przepustowość od 100 do ponad 80’000 komórek w ciągu 10 minut,
  • uzyskanie informacji o transkryptomie do 65% nałożonych komórek,
  • jedno urządzenie i wiele zestawów odczynników dedykowanych do poszczególnych aplikacji,
  • pełny pakiet oprogramowania do analizy i wizualizacji wyników.

Aplikacje wykorzystujące Single Cell Gene Expression:

  1. Charakteryzowanie limfocytów B i T
    Równoległa analiza tysięcy limfocytów w celu zdefiniowania genetycznego zróżnicowania limfocytów odpowiedzialnych za specyficzną i skuteczną odpowiedź układu odpornościowego. Możliwość sekwencjonowania regionów VDJ z rozdzielczością pojedynczej komórki. Rozwiązanie dedykowane dla immunologii, immunoonkologii czy badania chorób zakaźnych. Pobierz broszurę Immune Profiling.
  2. Analiza CNV w pojedynczych komórkach
    Rozwiązanie Chromium Single Cell CNV umożliwia odkrywanie heterogenności genomu i śledzenie zmian w klonalności próbki. Jest to niezbędne rozwiązanie dla zrozumienia procesów patogenezy. Pobierz broszurę Single Cell CNV.

Zastosowania

Szukaj w serwisie